- 党委办公室、校长办公室
- 纪委办公室、监察处、党委巡察工作办公室
- 党委组织部、党校、机关党委
- 党委宣传部
- 党委统战部
- 党委学生工作部（武装部）
- 学生就业指导中心
- 保卫处
- 工会
- 团委
- 研究生院、卓越工程师学院
- 发展规划处、战略与政策研究室
- 教务处(荟萃学院)
- 教师教学发展中心、教学质量评估中心
- 科技处、重大项目办公室
- 文科建设处
- 人事处、人才工作办公室、党委教师工作部
- 财务处
- 采购与招标办公室
- 审计处
- 国际合作与交流处、港澳台事务办公室、国际教育学院
- 国有资产管理处
- 实验室管理处
- 合作发展处、服务山东办公室
- 基建处
- 信息化建设处
- 离退休职工管理处（老干部处）
- 后勤管理处
- 古镇口校区综合办公室
- 北京离退休工作办公室
- 东营园区党委办公室、管委办公室
- 东营园区后勤保障处
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